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Implementazione di principii di dati FAIR - chì ci hè daretu à l'acronimu?

Avemu parlatu à Simon Hodson, Direttore Esecutivu, Cumitatu ISC di Dati (CODATA) per sapè di più.

I dati chì sustenenu a ricerca scientifica sò ciò chì alimenta i progressi in a cunniscenza scientifica. Questi datasets cuntenenu indizi vitali per parechje di e dumande più pressanti chì i scientisti facenu oghje, è ponu gettà una nova luce nantu à i risultati passati - sia validendu o invalidendu u record esistente di a scienza, è aprendu pussibulità per una nova ricerca è una nova comprensione. Tuttavia, stu tipu d'infurmazione spessu sparisce durante u prucessu di publicazione di scuperte scientifiche, o perchè e dati ùn sò micca spartuti, o micca dispunibuli in un formatu chì hè faciule d'accessu è di interrogazione.

"In a scienza, assai travaglii maravigliosi finiscinu publicati cum'è documenti PDF. Puderete stampà è leghje un articulu hè grande per l'omu, ma assai infurmazioni chì sò andati in a custruzzione di ciò chì hè rapportatu in u PDF finiscinu nascostu. Se vulemu ottene una vista di grande stampa, è fighjate à tutti l'esperimenti chì sò stati fatti è sò stati rappurtati in a literatura in relazione à un certu prucessu o reazione, hè assai difficiule per noi di caccià tutte l'infurmazioni da tutti quelli PDF. ", spiega Simon Hodson, Direttore Esecutivu di ISC-CODATA.

In e parolle di u chimicu Peter Murray-Rust, ottene informazioni utili da i PDF pò esse cum'è "ricustruisce una vacca da un hamburger di manzo".

Slide by Dunk via Flickr.

Ci hè una ricchezza di dati scientifichi chì sò stati produtti in u cursu di parechji anni di ricerca, ma in parechji casi, ùn hè micca pussibule. - è certamente micca faciule - per truvà quelli dati è interrugalli in modu di paragunà cù altri risultati o travaglii in corso. Di fronte à questu enigma, è in cunfurmità cù l'imperativu di a scienza aperta, i circadori sò attualmente travagliendu per attivà ancu più a scienza guidata da i dati attraversu quadri chì sustenenu l'accessibilità è l'interoperabilità di e dati.

Unu di l'ultimi è più impurtanti avvicinamenti à fà questu hè FAIR, chì encapsulates ciò chì dati deve esse per esse usable è preziosa cum'è pussibule: FAIR data hè data chì hè Findabile; Aaccessibile; Iinteroperabile è Re-utilizable.

"Findable" significa chì i dati scientifichi chì sò publicati cum'è parte di l'evidenza di basa per i scuperti scientifichi, o pruduciuti cum'è u risultatu di una ricerca finanziata publicamente, deve esse dispunibule per altri per truvà è aduprà. I dati duveranu avè un identificatore persistente è senza ambiguità, è ancu metadati abbastanza ricchi per attivà a scuperta.

"Ci sò boni ragiuni per a prutezzione di certi dati", dice Simon Hodson, "ma induve queste considerazioni ùn sò micca applicate, i principii FAIR significanu chì duvete pudè accede à e dati nantu à u web, forse cù l'autorizazione s'ellu ci sò prublemi di sicurezza. . Crucially, i principii FAIR mantenenu chì i scientisti deve esse capaci di accede à i dati di ricerca programmatically, chì hè da i so machini oltri. Ùn hè micca solu chì pudete uttene e dati è scaricallu: idealmente duvete esse capace di interrogà cù u codice di l'urdinatore ".

L'i in FAIR si riferisce à "interoperabile" - chì significa chì pudete cumminà dati da diverse fonti: questu dipende largamente da avè standard per metadati è terminologie o vocabulari accunsentiti. Per esempiu, i metadati per una indagine suciale da un paese determinatu spiegà chjaramente e categurie d'età o categurie socio-ecunomiche chì sò state aduprate, è induve si trovanu i limiti di a categuria, in modu chì e dati ponu esse facilmente paragunati cù dati da una indagine suciale. in un altru paese.

R sta per reusability: questu include avè una licenza chì permette à e persone di riutilizà e dati è dichjara chjaramente e cundizioni per ogni reutilizazione. Hè ancu significatu avè infurmazione nantu à a provenienza di e dati (per esempiu, cumu si sò stati riuniti, chì aghjustamenti o calibrazioni sò stati utilizati, quale ulteriore trasfurmazioni è a pulizia di e dati hè stata sottumessa, etc.) in modu chì i circadori ponu capisce i punti di forza potenziale è e limitazioni di i dati. i dati, è aduprà cun cunfidenza.

I dati FAIR sò ancu "Fully AI Ready". Per utilizà l'apprendimentu automaticu per identificà mudelli è cumincianu à predichendu i risultati in diversi set di dati, hè essenziale per avè definizioni per diverse variabili in u dataset, è e definizioni anu da esse facilmente accessibili.

"Quandu i dati è i servizii cunnessi sò FAIR, allora tuttu hè descrittu in modu chì l'urdinatore - è qualcunu chì usa u codice - sapi quale definizione hè stata aduprata per u cuncettu è a variabile ligata, a manera in quale e misurazioni sò state ottenute, è i valori stessi. Allora pudemu interagisce cù u codice di dati, forse decomposing it, piglià un subset, cumminendu cù altri dati. Se i dati sò FAIR, questu pò esse fattu assai più efficacimente è l'analisi è a ricerca stessu benefica ", dice Simon Hodson.

L'idea di avè un vocabulariu standardizatu cù quale spressione i cuncetti core in diversi regni di a scienza ùn hè micca novu. U Union Internationale di Chimica Pura è Applicata (IUPAC), un membru di l'ISC, hà rispostu à a necessità di standardizazione internaziunale in chimica da a so fundazione in 1919. Oghje, hè imperativu chì i vocabulari standard sò adattati à l'era digitale è sò stessi fatti FAIR. In u risultatu di un attellu urganizatu cù l'iniziativa di Documentazione di Dati, un gruppu guidatu da Simon Cox (anzianu membru di u Cumitatu Esecutivu CODATA è espertu in l'usu di terminologie) hà publicatu "Dieci regule simplici per fà un vocabulariu FAIR'.

In seguitu à queste linee guida, CODATA hè attualmente travagliendu in un vocabulariu FAIR per u Profili d'infurmazione di periculu publicatu da l'ISC in uttrovi 2021. Questu hà da creà una terminologia web-based per tutti i periculi descritti, chì serà dispunibule nantu à GitHub è via u serviziu Research Vocabularies Australia, per qualcunu à aduprà. Questu significa chì i guverni chì sviluppanu e so strategie è l'azzioni nantu à a riduzzione di u risicu è a gestione seranu capace di paragunà rapidamente e dati cù e so propria statistiche nantu à a perdita di disastru o quadri di rapportu, per esempiu.

CODATA travaglia ancu nantu à i vocabuli FAIR cù parechji membri di l'ISC, cum'è cù l'Unione Internaziunale per u Studiu Scientificu di a Populazione (IUSSP). A demografia hè un campu riccu di dati, è hè assai pertinente per capisce u sviluppu umanu sustinibili. Facendu terminologie chjave in a scienza di a pupulazione FAIR, l'IUSSP cuntribuiscerà à rende i dati demografichi più utili per l'agenzii di statistiche è i scientisti suciali, è ancu quelli chì utilizanu tali dati in i numerosi campi di studiu chì utilizanu dati di a pupulazione, cumprese a maiò parte di e zone relative à u Sostenibile. Obiettivi di Sviluppu (SDGs).

CODATA intraprenderà ancu un travagliu simile cù IUPAC cum'è parte di u novu prughjettu di dui anni "WorldFAIR: Cuuperazione glubale nantu à a pulitica è a pratica di dati FAIR", finanziatu da a Cummissione Europea à traversu u so Programma quadru Horizon Europe. Cuurdinatu da CODATA, Cù u Research Data Alliance associazione cum'è un associu maiò, u prughjettu WorldFAIR hà da travaglià cù un inseme di undici studii di casu di duminiu è cross-domain per avanzà l'implementazione di i principii di dati FAIR, in particulare quelli per l'interoperabilità, è per sviluppà un inseme di raccomandazioni è un framework per FAIR. valutazione in un inseme di discipline, o spazii di ricerca cross-disciplinary. WorldFAIR formarà u core di a cuntribuzione di CODATA à u Prughjettu ISC Fà u travagliu di dati per i Grandi Sfidi Cross-Domain.

IUPAC hè guidanu u studiu di casu di chimica, fighjendu cumu fà l'assi di l'infurmazioni è e terminologie chì IUPAC curate apprupriati per l'età di digitalizazione è dati FAIR. L'IUPAC s'impegnarà ancu cù altri studii di casu WorldFAIR nantu à i nanomateriali è a geochimica.

Un altru cumpagnu WorldFAIR hè Drexel University, USA, chì hà guidatu u prughjettu Salud Urbana en América Latina ("Salute Urbana in America Latina") (SALURBAL). SALURBAL hà sviluppatu a Dataset multi-paese nantu à duminii cum'è e caratteristiche demografiche, i tassi di mortalità, i cumpurtamenti è i risichi per a salute, l'ambiente suciale è l'ambiente custruitu, chì permette paraguni di cità è quartieri in cità in tutta l'America Latina. Questa risorsa maravigghiusa permetterà a ricerca pertinenti à a pulitica nantu à i mutori di salute è inuguaglianze di salute in e cità di a regione. SALURBAL hà digià fattu un vastu travagliu nantu à l'armonizazione di dati. WorldFAIR aiuterà à sparghje più luce nantu à stu travagliu è farà cunsiglii per e terminologie FAIR in a salute urbana.

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Serie di podcast CAG-CEPT, CODATA è UHWB nantu à "Data-Knowledge-Action for Urban Systems"

A serie di podcast Data-Knowledge-Action for Urban Systems esplora i sistemi usati per custruisce sistemi urbani intelligenti. A serie riflette nantu à i cambiamenti sistematichi necessarii per e cità per diventà adattative è intelligenti per trattà u benessere urbanu. Hè ospitatu da u Centru per a Geomatica Applicata, CODATA è u Programma di Salute è Benessere Urbanu (UHWB).


U 15 è u 16 di ferraghju, Simon Hodson hà datu un briefing annantu à u travagliu di CODATA in a sessione di spartera di cunniscenza per i membri di l'ISC. Cunvergenza di a scienza è a tecnulugia in una era digitale.

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Pudete sapè di più nantu à u prughjettu WorldFAIR, nantu à u travagliu di CODATA nantu à i vocabulari FAIR è nantu à iniziative in diverse discipline di ricerca per fà dati è infurmazioni FAIR à Settimana Internaziunale di Dati 2022, 20-23 ghjugnu.


Image by École polytechnique – J.Barande via Flickr.